基因组目标区域重测序
使用Illumina Genome AnalyzerⅡ对基因组挑选某些特定区域进行测序。节约了测序成本和时间，有助于发现大量个体基因变异、靶向筛选核酸序列等。
Small RNA测序
Small RNA 是一类长度18-30nt的非编码RNA，主要包括miRNA、siRNA、piRNA三大类。使用二代测序平台对其进行测序及分析。
简化甲基化测序
RRBS(Reduced representation bisulfite sequencing) ，即简并代表性亚硫酸氢盐测序技术，仅对高CpG区域进行测序。
动植物基因组重测序
全基因组重测序是对已知参考基因组序列的物种进行不同个体间的基因组测序，并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。应用范围涉及临床医药研究、群体遗传学研究、关联分析、进化分析等众多领域。
土壤微生物多样性分析
基于16S/18S/ITS序列扩增，根据客户需求采用不同测序平台（Roche 454和 Illumina），利用NGS高通量测序技术，获得庞大的数据信息，通过现代生物信息学手段，获得微生物总体群落.
染色质免疫共沉淀技术测序（chip-seq 组蛋白 转录因子）
将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。
microRNA（miRNA）测序技术服务
康成生物以Illumina Genome Analyzer IIx为技术平台，提供microRNA测序服务。高通量测序技术具备数字化信号、任意物种的高通量分析、高灵敏度、高质量数据、高置信度等优势。