MetPro-II：代谢-蛋白互作在精准医疗药物筛选中的突破与应用
随着科技的飞速发展，医疗行业也正经历着一场深刻的变革。在这个背景下，精准医疗应运而生，成为了当今医疗领域的热门话题，然而精准药物筛选的研究当中一直存在这些问题：
1. 小分子药物作用靶点未知
2. 药物作用机制不明确
为了解决这些难题，百趣推出了MetPro-II技术，该技术使用化学蛋白质组学方法，可以快速筛选到与代谢物有互作作用的蛋白质。作为蛋白代谢互作前沿技术，自2019年上市以来，已经协助客户发表多篇高分文献。下面，我们来分享几篇MetPro-II技术参与研究的文章。
案例一
文章标题：Inhibition of UBA6 by inosine augments tumour immunogenicity and responses
发表期刊：Nature Communications
影响因子：14.7
研究概述：抗癌免疫和对免疫治疗的反应受肿瘤代谢状态的影响。免疫检查点阻断疗法(Immune checkpoint blockade therapy, ICB)已知涉及代谢适应，但其机制尚不完全清楚。该研究通过对接受ICB治疗的癌症患者和小鼠肿瘤模型的血浆进行非靶向代谢组学分析，发现较高水平的嘌呤代谢物（包括肌苷）标志着ICB敏感性。此外，通过MetPro-II代谢蛋白互作蛋白组学技术方法确定了肌苷在小鼠和癌症患者肿瘤细胞中的直接靶点，并通过遗传方法验证了其在小鼠模型中的功能。作者确定UBA6作为限制抗肿瘤免疫的肿瘤内在检查点，并揭示UBA6是免疫治疗的有吸引力的靶点，其研究结果强调了肌苷与ICB结合在高UBA6表达的癌症患者中的潜在应用。
技术流程：
案例二
文章标题：Targeting phenylpyruvate restrains excessive NLRP3 inflammasome activation and pathological inflammation in diabetic wound healing
发表期刊：Cell Report
影响因子：7.5
研究概述：探讨免疫调节代谢物在糖尿病伤口愈合中过度炎症的作用机制，并提出针对苯丙酮酸(PPA)的潜在治疗策略。通过代谢组学分析发现，糖尿病足溃疡中有显著的PPA积累，该物质会损害伤口愈合并增强炎症反应。通过MetPro-II代谢蛋白互作蛋白组学技术方法确定PPA是通过CD36受体进入巨噬细胞中的，它与PPT1蛋白结合并抑制去棕榈酰化酶活性，从而增加NLRP3蛋白的棕榈酰化水平。这种增加的NLRP3棕榈酰化可以促进NLRP3炎性小体激活和IL-1β等炎症因子的释放，最终导致促炎症性巨噬细胞表型的形成。因此，本研究发现针对PPA的治疗方法可能有助于预防糖尿病伤口中的过度炎症。
技术流程：
案例三
文章标题：Traumatic acid inhibits ACSL4 associated lipid accumulation in adipocytes to attenuate high-fat diet-induced obesity
发表期刊：The FASEB Journal
影响因子：4.8
研究概述：探索创伤酸(TA)对脂肪细胞脂质积累的影响及其在高脂饮食诱导肥胖中的作用机制。研究发现，TA能够显著减少人类脂肪细胞的脂质积累，并预防小鼠高脂饮食引起的肥胖。通过转录组测序和Western blotting等方法，研究人员发现了TA激活脂肪酸降解和代谢信号通路，并抑制长链酰辅酶A合成酶-4(ACSL4)的表达。此外，研究人员还利用MetPro-II代谢蛋白互作蛋白组学技术方法证实了TA直接作用于肝糖原激酶2(HK2)，并通过分子基础证明TA可能通过HK2-ACSL4轴发挥作用。这项研究为开发有效的干预策略提供了新的思路。
技术流程：
以上文献均利用了百趣提供的MetPro-II技术，并在研究中起到关键的作用，那么MetPro-II技术究竟是什么？接下来让我们一起揭开它神秘的面纱。
MetPro-II技术是一种化学蛋白质组学方法，将蛋白质水解(LiP)和质谱(MS)结合起来，用于进行代谢物-蛋白质相互作用的研究，筛选与代谢物具有相互作用的蛋白质。
MetPro-II 技术流程
MetPro-II 实验流程
MetPro-II 应用方向
1. 发现药物的作用靶点；
2. 研究小分子代谢物的作用机制；
3. 小分子代谢物作用机制研究：研究小分子代谢物对生化过程、信号通路等的影响；
4. 网络图构建：与其他功能组学数据结合如PPI网络、PTM蛋白质翻译后修饰或代谢流，为不同细胞调控层之间的交互影响(crosstalk)带来新方向。
MetPro-II 技术优势
1. 简单高效的发现小分子代谢物与蛋白相互作用，灵敏度高；
2. 不需要对配体进行任何化学修饰，也不偏向具有特定性质的化合物；
3. 直接在复杂的生物样品中展开研究，而不需要进行蛋白质纯化或浓缩。
MetPro-II 特色专属服务
MetPro-II代谢物与蛋白互作产品，配套卓越的分子对接分析服务，可以靶向筛选药物候选分子，加速药物发现和设计进程，能够精确定位代谢物与蛋白质之间的交互界面，预测它们的结合模式与亲和力。
热门技术MetPro-II，协助高分文章发表，百趣生物等着您来！
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LQP 撰文
Uki 校稿